本公告是对NextSeq™1000/2000 v1.2控制软件release notes的概述，并指导客户完成安​​装流程。此说明仅适用于控制软件v1.2的升级。软件安装程序和release notes可以在 NextSeq 1000/2000 Control Software Suite v1.2.0 页面找到。

制定实验计划时请预留至多2个小时的软件升级时间（不含软件下载时间）。

如果要安装DRAGEN Enrichment v3.7.4，必须首先按照此处概述的步骤将NextSeq 1000/2000控制软件更新为v1.2。

注意：如果要安装多个DRAGEN workflows，请参考各自Install DRAGEN workflows的详细步骤。

准备 |  在线安装 | 离线安装 | 已知的问题

1.  总安装时间（不包括文件下载时间）最多可能需要2个小时。

2. 对于离线客户，需要获取更新的DRAGEN许可证文件：

• 重新安装请联系customercare@illumina.com申请离线版DRAGEN许可证。以ilmnadmin账户身份登录机器，并将此license.zip文件保存到桌面。

3.    因为需要访问ilmnadmin帐户，因此请确保提供正确的凭证。

4.    登录到ilmnadmin帐户：

a. 如果已经以ilmnuser身份登录并且打开了控制软件，请在控制软件菜单里选择“Exit Application”进入到桌面界面。

b. 点击屏幕右上角的电源按钮图标，然后选择ilmnuser->Log Out，退出ilmnuser账号。

c. 在登录界面，选择ilmnadmin，然后输入密码，登录ilmnadmin账户。

d. 控制软件将自动启动。

5.    升级安装文件最多需要16 GB的桌面可用空间。请按照以下步骤释放桌面空间。

a. 在控制软件中点击控制软件菜单，然后选择Minimize Application，进入桌面界面。

b. 从桌面删除或转移不需要的文件。

c. 清空垃圾桶以释放磁盘空间。

i. 选择Applications，然后从桌面的左上角选择Files以启动文件浏览器。

ii. 在文件资源管理器的左侧面板上，右键单击Trash图标，然后选择Empty Trash

6. 如仪器已联网，可直接在仪器上启动Chromium，从Illumina Support网站下载软件升级安装程序。如仪器未联网，请使用其他联网电脑下载软件升级安装程序并拷贝到仪器的桌面。

• 在桌面视图界面，打开左上角的Applications菜单。选择Internet，然后选择Chromium。

注意：如果启动Chromium之后出现unlock login keyring的提示，请忽略并取消提示

 

• 在Chromium浏览器打开Illumina支持网站上的NextSeq 1000 and 2000 Software Downloads页面。

7.    从Illumina支持网站下载以下软件升级安装程序，并将其保存到桌面。不要解压缩这些文件；将其保留为.tar.gz格式。

• 使用在线升级需要下载的文件有：

i. DRAGEN Workflows (13 GB)
ii. DRAGEN compression reference file (1.5 GB)

• 使用离线升级需要下载的文件有：

i. v1.2 SW Suite Installer (1 GB)
ii. DRAGEN Workflows (13 GB)
iii. DRAGEN compression reference file (1.5 GB)
iv. 将license.zip 文件保存到桌面。不要解压缩，将其保留为license.zip

 

在线安装

注意：在继续之前，请确认上一节中概述的准备步骤已完成

1. 安装软件套件

a) 在控制软件通知面板中选择software update alert，然后按照提示升级软件套件。

b) 安装过程完成后，将显示确认安装成功的提示，并显示重要的提示。确认提示后，控制软件将自动重新启动。

c) 按照提示进行固件更新。

注意：在此过程中，屏幕将变为空白。请耐心等待图像出现完成该过程。如果5分钟后图像仍未恢复，请手动拨动仪器底部电源开关完成仪器重启。

d) 按照提示重启仪器。

 注意：请确保在仪器关闭后拨动仪器底部的电源开关以完成仪器重启。

e) 打开仪器并以ilmnadmin身份登录。控制软件将自动启动。
注意：出现警报，指示需要更新DRAGEN workflows。继续执行以下步骤来解除警报。

f) 在控制软件菜单的About界面中，确认版本已更新为1.2。

g) 继续执行下一步以安装DRAGEN workflows。

2. 安装DRAGEN workflows和DRAGEN compression reference file。

a) 选择控制软件菜单，之后选择DRAGEN。

b) 在Version部分，选择Browse for New Version。

c)  在浏览窗口中选择并双击桌面上的DRAGEN Enrichment workflow *.tar.gz 压缩包。

d)     在控制软件DRAGEN窗口，选择Install 。

e)     弹出提示框，输入ilmnadmin的密码。

f)  对于其他的DRAGEN workflow *.tar.gz 压缩包，重复上述步骤安装。

g)  确认安装的DRAGEN Enrichment workflow 版本已更新到3.7.4。

h)   继续下面步骤安装DRAGEN compression reference file。

3.  安装DRAGEN compression reference file。

a) 选择控制软件菜单，然后选择DRAGEN。

b) 在Genome部分，选择Import New Reference Genomes下面的Choose，找到dragen_compression_ref.tar.gz文件，然后选择Open。

c) 选择Import。 

d) 继续下面步骤更新GRAGEN许可证。

4.  更新GRAGEN许可证

a) 打开控制软件菜单。

b) 在License Renewal下面，选择Renew Online。

c) 确保许可证有效且没有过期（可在控制软件About界面确认）。

5. 最后步骤

a)  安装完成后，将桌面上所有下载的安装文档删除并清空垃圾桶以节省空间。

b) 登录ilmnuser开始测序。

离线安装

注意：在继续之前请参考前一节 Preparation步骤

1.     安装软件套件

a)     启动控制软件

 i. 打开控制软件。
ii.  选择Software Update。
iii. 在Browse for Software Update下面选择 Choose 。

iv.  选择桌面上的安装程序。

v.  选择Update Now。

b) 输入ilmnadmin密码并按照提示更新软件套件。

 

 

c) 安装过程完成后，将显示确认安装成功的提示，并显示重要提示。确认提示后，控制软件将自动重新启动。

d) 按照提示进行固件更新。注意：在此过程中，屏幕将变为空白。请耐心等待图像出现完成该过程。如果5分钟后图像仍未恢复，请手动拨动仪器底部电源开关重启仪器。

e) 按照提示重启仪器。

 注意：请确保在仪器关闭后拨动仪器底部的电源开关以完成仪器的重启。

f) 打开仪器并以ilmnadmin身份登录。控制软件将自动启动。
注意：出现警报，指示需要更新DRAGEN workflows。继续执行以下步骤来解除警报。

g) 在控制软件菜单的About界面确认软件版本已更新至1.2。

h) 继续下面步骤安装DRAGEN workflows。

2. 安装DRAGEN workflows 和 DRAGEN compression reference file

a) 选择控制软件菜单，然后选择DRAGEN。

b) 在Version部分，选择Browse for New Version。

c) 在浏览器窗口，选择并双击桌面上的DRAGEN Enrichment workflow *.tar.gz 压缩包。

d) 在控制软件DRAGEN窗口，选择Install。

e) 当出现提示，输入ilmnadmin的密码。

f) 重复上述步骤安装其他的DRAGEN workflow *.tar.gz压缩包。

g) 确认安装的DRAGEN workflows 版本已更新为3.7.4。

h) 继续下面步骤安装DRAGEN compression reference file。

3. 安装DRAGEN compression reference file

a) 选择控制软件菜单，然后选择DRAGEN。

b) 在Genome部分选择Import New Reference Genomes下面的Choose, 找到dragen_compression_ref.tar.gz文件，然后选择Open。

c) 选择Import。 

d) 继续下面步骤更新DRAGEN许可证。

4. 更新DRAGEN许可证

a) 在控制软件界面

                i.          打开控制软件菜单。
               ii.          选择DRAGEN。
              iii.          选择License Renewal下面的Choose Offline 。

              iv.          选择桌面上的license.zip文件。
               v.          选择Update。

b) 确保许可证有效且没有过期（可以在控制软件About界面确） 。

c) 最后的步骤

i. 安装完成后，将桌面上所有下载的安装文档删除并清空垃圾桶以节省空间。
ii. 登录ilmnuser开始测序。

已知的问题

· 在安装软件套件时，固件升级之后，屏幕可能持续空白。如果5分钟后图像仍未恢复，请切换电源开关并继续。

· 升级过程开始时可能会出现以下信息并阻止软件套件的安装：“Update cannot continue because the following actions are currently in progress: data file copy.”此消息表明有文件正在传输中。如果此问题持续存在，请联系Illumina技术支持。