NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
혈액, 골수, FFPE 조직을 포함한 많은 RNA 검체 유형에서 유전자 발현, 변이, 융합 검출 연구를 위한 1385개의 암 유전자를 표적으로 삼는다.
Assay 시간
수작업 시간
사용량
MiniSeq 시스템에 사용할 수 있는 시약 및 라이브러리 준비 키트 번들
MiniSeq 시약과 라이브러리 준비 키트를 함께 주문하여 추가 비용 절감과 편의성을 확보하십시오(카탈로그 번호 20005611).
TruSight RNA Pan-Cancer 패널은 벤치탑 시퀀싱 시스템에서 제한적이고 분해된 샘플에서 암 관련 RNA 전사물에 대한 심층적이고 비용 효율적인 평가를 제공합니다.
라이브러리는 최소 10 ng의 총 RNA 투입량(또는 FFPE 검체로부터 20 ng)으로 준비할 수 있다. 관련 유전자의 하위 집합에 초점을 맞추면 높은 민감도를 갖는 RNA-Seq가 가능하다.
분석은 유전자 발현 프로파일을 제공하고, 유전자 융합을 식별하고, 단일 뉴클레오티드 변이체 및 작은 인델을 보고하여 암 연구자들에게 포괄적이고 직관적인 솔루션을 제공하는 BaseSpace RNA-Seq 정렬 앱을 사용하여 수행될 수 있다.
BaseSpace Sequence Hub에 등록하거나 로그인하여 MiSeq 시스템 데이터 및 MiniSeq 시스템 데이터에 액세스합니다(실행 보기 또는 프로젝트 보기 ).
Assay 시간 | 2.5일 |
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자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
Cancer type | Pan-cancer, Hematologic, Solid tumor |
콘텐츠 사양 | 1,385개의 표적 유전자와 21,043개의 표적 엑손 영역이 포함된 전체 고형암 패널. 암 유전자 융합과 관련된 유전자 507개 포함. |
설명 | 다양한 암 유형의 유전자 융합, 변이 및 유전자 발현 변화에 대한 연구를 지원하는 암 관련 RNA 전사물의 포괄적인 평가를 수행합니다. |
수작업 시간 | 11시간 |
사용량 | Total RNA 10 ng, FFPE RNA 20~100 ng |
Instruments | MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 System |
방법 | Targeted RNA sequencing, Target enrichment, Custom sequencing |
Nucleic acid type | RNA |
특수 샘플의 종류 | Low-input samples, FFPE tissue |
Species category | Human |
Technology | Sequencing |
변이 클래스 | Gene fusions, Somatic variants, Novel transcripts, Transcript variants |
TruSight RNA 팬 암 패널 세트 A 및/또는 B를 구매해야 합니다. 각 세트에는 12개의 인덱스가 있는 48개 샘플에 대한 라이브러리 준비 시약 및 올리고가 포함됩니다. 각 지표는 4개의 개별 검체에 충분하다. 두 세트 모두 함께 사용하여 최대 24개의 검체를 모을 수 있습니다.
MiniSeq 시스템을 사용하는 경우, TruSight 팬-암 세트 A MiniSeq 키트에서 시약 및 라이브러리 준비 키트를 함께 주문할 수 있습니다.
TruSight RNA 팬-암 패널은 연구를 위한 FFPE 조직 및 기타 종양학 검체에서 암 관련 RNA 전사 및 융합 검출에 대한 종합적인 평가를 제공합니다.
기기 | Recommended number of samples | Read length |
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MiniSeq System | Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 3 million reads per sample) |
2 × 75 bp(최대 권장) |
MiSeq System | 8 samples per run with v3 reagents (based on 3 million reads per sample) |
2 × 75 bp(최대 권장) |
Pan-cancer analysis with NGS comprehensively assesses gene variants and abnormalities associated with many common cancers, regardless of tumor origin.
Detect cancer gene expression and transcriptome changes and identify novel cancer transcripts with RNA next-generation sequencing (RNA-Seq).
Find FFPE RNA sequencing solutions that yield high-quality results from degraded FFPE tissues and other low-quality samples.
TruSight RNA Pan-Cancer Panel | TruSight RNA Fusion Panel | |
---|---|---|
Assay 시간 | 2.5일 | 2.5일 |
자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
Cancer type | Pan-cancer, Hematologic, Solid tumor | Pan-cancer, Hematologic, Solid tumor |
콘텐츠 사양 | 1,385개의 표적 유전자와 21,043개의 표적 엑손 영역이 포함된 전체 고형암 패널. 암 유전자 융합과 관련된 유전자 507개 포함. | |
설명 | 다양한 암 유형의 유전자 융합, 변이 및 유전자 발현 변화에 대한 연구를 지원하는 암 관련 RNA 전사물의 포괄적인 평가를 수행합니다. | 암 연구를 위한 비용 효과적인 NGS 솔루션을 제공하여 고형 종양, 육종, 혈액암을 포함한 여러 암 유형에 관여하는 507개의 유전자를 심층적으로 포괄합니다. |
수작업 시간 | 11시간 | 11시간 |
사용량 | Total RNA 10 ng, FFPE RNA 20~100 ng | Total RNA 10 ng, FFPE RNA 20~100 ng |
Instruments | MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 System | MiSeq System, NextSeq 550 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 500 System |
방법 | Targeted RNA sequencing, Target enrichment, Custom sequencing | Targeted RNA sequencing, Target enrichment |
Nucleic acid type | RNA | RNA |
특수 샘플의 종류 | Low-input samples, FFPE tissue | Low-input samples, FFPE tissue |
Species category | Human | Human |
Technology | Sequencing | Sequencing |
변이 클래스 | Gene fusions, Somatic variants, Novel transcripts, Transcript variants | Gene fusions |
Library Prep and Array Kit Selector
Find the right sequencing library preparation kit or microarray for your needs. Filter by method, species, and more. Compare, share, and order kits.
TruSight 팬-암 포획 화학
TruSight RNA PanCancer 패널은 총 RNA로부터 표적 관심 영역을 분리하는 간단하고 간결한 방법을 제공합니다.
새로운 유전자 융합 파트너 식별
(A) 흑색종에서 유래한 3개의 다른 FFPE 검체로부터 얻은 총 RNA의 크기 분포는 생체시료분석기에 나와 있다. (B) 표는 융합 쌍의 하나의 유전자(강조 표시)만 표적화될 때 FFPE 샘플에서 유전자 융합 파트너의 검출을 보여준다.
TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A
RS-303-1002
12개 인덱스가 있는 48개 샘플에 대한 라이브러리 준비 시약 및 올리고가 포함되어 있습니다. 각 인덱스는 4개의 개별 샘플에 사용하기에 충분합니다. TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B와 함께 사용하면 최대 24개의 샘플을 풀링할 수 있습니다.
List Price:
Discounts:
TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B
RS-303-1003
12개 인덱스가 있는 48개 샘플에 대한 라이브러리 준비 시약 및 올리고가 포함되어 있습니다. 각 인덱스는 4개의 개별 샘플에 사용하기에 충분합니다. TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A와 함께 사용하면 최대 24개의 샘플을 풀링할 수 있습니다.
List Price:
Discounts:
TruSight RNA Pan-Cancer Set A MiniSeq Kit
20005611
12개의 인덱스가 있는 48개의 샘플에 대한 라이브러리 준비 시약 및 올리고와 6개의 MiniSeq High Output Kit(150사이클)가 포함되어 있습니다.
List Price:
Discounts:
Trusight RNA Pan-Cancer Oligo Panel
20046104
Trusight RNA Pan-Cancer Oligo Panel에는 1플렉스 인리치먼트를 사용하는 경우 시퀀싱을 위한 총 96개의 RNA 샘플에 충분한 올리고가 포함되어 있고, 3플렉스* 인리치먼트를 사용하는 경우 시퀀싱을 위한 288개의 총 RNA 샘플에 충분한 올리고가 포함되어 있습니다. 이 패널에는 라이브러리 준비가 포함되어 있지 않습니다. *멀티플렉싱 인리치먼트를 허용하는 라이브러리 준비 워크플로우에만 적용됩니다.
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단가
TruSight RNA Pan-Cancer 작업 흐름에는 6가지 주요 단계가 포함됩니다.
프로브는 1385개의 암 유전자를 표적화하고 모든 유전자의 모든 엑손에 걸쳐 융합을 검출하도록 설계된다.
MiSeq 시스템에서 RNA-Seq 워크플로(FASTQ만 해당)를 실행하고 BaseSpace Sequence Hub로 데이터를 스트리밍합니다. BaseSpace RNA-Seq 정렬 앱은 TruSight RNA 팬-암 패널의 데이터를 분석하여 융합 표, 변이체 표 및 유전자 발현 표를 포함하는 간단한 결과 요약을 제공합니다. 또한 분석을 위해 자체 파이프라인을 사용할 수도 있습니다.
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