품질 관리를 위해 iSeq 100 시스템 사용
Texas A&M AgriLife의 유전체학 및 생물정보학 담당 이사인 Charlie Johnson이 그의 실험실에서 품질 관리를 위해 iSeq 100 염기서열 분석 시스템을 NovaSeq 6000 염기서열 분석 시스템과 어떻게 페어링하는지, 그리고 iSeq 100 시스템이 워크플로우에 중요한 역할을 하게 된 이유에 대해 논의합니다.
연구 규모의 확장
실험실 내에서 사용하기 쉽고 저렴한 에코시스템에서 Illumina 차세대 시퀀싱(NGS) 기술의 성능을 활용하십시오.
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Illumina 포트폴리오에서 가장 저렴하고 컴팩트한 벤치탑 시퀀싱 시스템을 살펴보고 실험실에서 NGS의 성능을 활용하는 것이 얼마나 쉬운지 알아보십시오.
iSeq 100 시스템은 상보적 산화금속 반도체(CMOS) 기술의 속도와 경제성, 합성(SBS) 화학에 의한 시퀀싱의 정확성을 활용하여 거의 모든 실험실에서 강력한 NGS 기술을 획득할 수 있도록 지원합니다.
iSeq 100 시스템은 qPCR 및 Sanger 시퀀싱에 비해 더 높은 데이터 해상도와 더 깊은 커버리지를 모두 제공하여 결과 도출 시간을 단축하고 실제 단계를 줄이면서 변이 또는 저주파 대립 유전자를 검출하는 데 대한 통계적 신뢰도를 높일 수 있습니다.1,2
더 큰 시퀀싱 시스템 또는 아웃소싱에 비해 iSeq 100 시스템은 빠르고 비용 효율적인 소규모 실행, 아웃소싱의 독립성, 처음부터 끝까지 시퀀싱 프로세스의 제어를 제공합니다.
지원되는 가장 긴 판독 길이에 대해 최대 출력이 1.2Gb인 iSeq 100 시스템은 소유전체 염기서열 분석, 표적 유전자 염기서열 분석 및 유전자 발현 프로파일링을 포함한 다양한 DNA 및 RNA 염기서열 분석 애플리케이션에 대해 신속한 다중 염기서열 분석을 제공합니다.
Westmead Institute for Medical Research의 Viromics 실험실 수석 과학자인 John-Sebastian Eden 박사가 염기서열 분석 프로젝트를 사내에 도입했습니다. 그가 iSeq 100 시스템을 결정한 이유와 방법을 알아보십시오.
시스템 사양
신속하고 비용 효과적인 유전자 분석을 수행하려는 모든 실험실에 이상적인 iSeq 100 시스템을 만드는 포괄적이고 간소화된 워크플로우.
Clarity LIMS 소프트웨어 또는 기존 LIMS 시스템으로 워크플로를 원활하게 관리하십시오.
고성능 라이브러리 준비 키트로 다양한 애플리케이션을 위한 라이브러리를 준비하십시오.
9.5시간 만에 합성 화학을 통해 입증된 Illumina 시퀀싱을 특징으로 하는 즉시 사용 가능한 시약으로 시퀀스를 생성합니다.
기기 소프트웨어, 로컬 실행 관리자 및 터치스크린 인터페이스를 사용하여 시퀀싱 실행을 모니터링하고 분석합니다.
BaseSpace Sequence Hub에 있는 앱을 사용하여 결과를 해석하고 공유합니다.
iSeq 100 시스템은 실행당 최대 1.2Gb의 출력 범위, 최적화된 라이브러리 준비 키트, 고해상도 및 분석 민감도를 갖추고 있으며, 소형 유전체 시퀀싱, 16S 메타지노믹스 연구, 유전자 편집 검증 등을 포함한 다양한 응용 분야에 적합한 다목적 옵션입니다.
Texas A&M AgriLife의 유전체학 및 생물정보학 담당 이사인 Charlie Johnson이 그의 실험실에서 품질 관리를 위해 iSeq 100 염기서열 분석 시스템을 NovaSeq 6000 염기서열 분석 시스템과 어떻게 페어링하는지, 그리고 iSeq 100 시스템이 워크플로우에 중요한 역할을 하게 된 이유에 대해 논의합니다.
입증된 앰플리콘 화학은 암 관련 표적 염기서열분석 응용 분야를 위한 업계 최고의 염기서열분석 기술을 충족합니다.
iSeq 100 System |
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런 타임 | 9~19시간 | 4~24시간 | 5~55시간 |
런당 최대 데이터 아웃풋 | 1.2 Gb | 7.5 Gb | 15 Gb |
실행당 최대 단일 읽기 수 | 4M | 25M a | 25M b |
최대 읽기 길이 | 2 × 150 bp | 2 × 150 bp | 2 × 300 bp |
데이터 분석 제공c | BaseSpace Sequence Hub, Illumina Connected Analytics, 온프레미스 DRAGEN 서버 | BaseSpace Sequence Hub, Illumina Connected Analytics, 온프레미스 DRAGEN 서버 | BaseSpace Sequence Hub, Illumina Connected Analytics, 온프레미스 DRAGEN 서버 |
a. MiniSeq 고출력 시약 키트 전용.
b. MiSeq 시약 키트 v3 전용.
c. 전용 DRAGEN 서버는 Illumina 시퀀싱 시스템과 쌍을 이루며, Illumina Run Manager를 사용하여 시퀀싱 실행의 일부로서 이차 분석을 계획하는 데 사용될 수 있다. 온프레미스 DRAGEN 서버는 시퀀싱 시스템과 직접 통신하지 않지만, 명령줄을 통해 임의의 Illumina 시퀀싱 시스템으로부터 데이터를 수집 및 처리할 수 있다.
차세대 시퀀싱(NGS)에 대해 알아보고 시퀀싱 프로젝트를 시작하기에 적합한 제품을 선택하는 데 도움이 되는 교육 및 지원 리소스를 찾아보십시오.
단계별 가이드 및 교육 비디오를 사용하여 iSeq 100 시스템을 시작하는 방법을 알아보십시오. NGS를 얼마나 손쉽게 검사실에 도입할 수 있는지 확인하세요.
우리는 NGS 데이터 분석 프로세스에서 대부분의 수동 작업을 제거했습니다. Local Run Manager 소프트웨어는 모든 iSeq 100 시스템에 설치되어 있으며 자동으로 기기 내 데이터 분석을 수행합니다. 이 소프트웨어는 시퀀싱 시작, 시퀀싱 상태 모니터링, 결과 확인 및 데이터 분석을 수행하는 사용이 용이한 터치스크린 인터페이스를 갖추고 있습니다.
iSeq 100 시스템은 직접 설치하기 쉽습니다. 시작하는 데 도움이 되는 다양한 지원 리소스를 이용할 수 있습니다. Illumina 과학자와 엔지니어는 온라인 또는 직접 지원 및 교육을 제공하여 실험실 직원이 신속하게 업무를 처리할 수 있도록 지원합니다. 장기 유지보수의 경우, 이 시스템은 가동 중단 시간을 최소화하기 위해 교체 기기 또는 현장 서비스 엔지니어 지원(지역에 따라 다름)을 포함하는 1년 보증이 적용됩니다.
참고 문헌
실험실이 이 작고 강력한 벤치탑 시퀀싱 시스템의 혜택을 받을 수 있는지 결정하는 데 도움을 받으십시오. iSeq 100 시스템에 대한 자세한 내용은 지금 문의하십시오.
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