차세대 시퀀싱(NGS)

접근이 용이한 전장 유전체 시퀀싱

모세관 전기영동(capillary electrophoresis) 기반의 생어 시퀀싱을 활용한 Human Genome Project에는 10년이 넘는 기간 동안 약 30억 달러가 투입되었습니다.

그에 반해 NGS는 일반 연구자가 대규모 전장 유전체 시퀀싱(whole-genome sequencing, WGS)에 더 쉽고 실용적으로 접근할 수 있도록 해 줍니다. 이를 통해 과학자들은 한 번의 시퀀싱 실험으로 인간 전장 유전체를 분석하거나, 1년에 수천에서 수만 개의 유전체를 시퀀싱할 수 있습니다.

WGS에 대해 더 알아보기

발현 프로파일링을 위한 광범위한 동적 범위(dynamic range)

NGS 기반 RNA-Seq은 연구자들이 마이크로어레이(microarray)와 같은 기존 기술의 비효율성과 비용 문제를 해결할 수 있게 해 주는 강력한 방법입니다. 마이크로어레이 유전자 발현량 측정은 로우 엔드(low end)의 경우 노이즈, 하이 엔드(high end)의 경우 시그널 포화로 인한 한계가 존재합니다.

이에 반해 NGS는 이산적 디지털 시퀀싱 리드(read) 수를 정량화하므로 보다 광범위한 동적 범위를 제공합니다.^1,2,3

어레이(array)와 RNA-Seq 비교하기

해상도 조정이 가능한 표적 NGS

표적 시퀀싱은 유전자의 하위 집합 또는 특정 관심 유전체 영역을 시퀀싱하여 NGS의 성능을 효율적이고 비용 효과적으로 집중할 수 있게 해 줍니다. 확장성이 매우 우수한 NGS는 연구자가 실험 요건에 따라 해상도를 조정할 수 있도록 해 줍니다. 많은 샘플을 사용하여 낮은 뎁스(depth)에서 스캔을 수행할 수도 있고, 비교적 적은 수의 샘플을 사용하여 더 높은 뎁스에서 시퀀싱을 수행하여 특정 영역에서 희귀 변이를 찾을 수도 있습니다.

다음 사항에 대해 더 알아보세요.

• 표적 시퀀싱
• NGS와 생어 시퀀싱의 비교
• NGS와 qPCR의 비교

Genetics of COVID-19 Susceptibility

영국 전역에 걸쳐 진행된 이 연구에서는 감염 취약성과 연관성이 있는 유전적 요인을 파악하기 위해 NGS를 활용하여 중증 및 경증 COVID-19 환자의 유전체를 비교하였습니다.

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Exploring the Tumor Microenvironment

여러 과학자들이 암 미세환경(microenvironment) 연구, 유전자 발현 패턴 규명, 약물 내성 및 전이에 대한 인사이트를 얻기 위해 단일세포 NGS 기법을 활용하고 있습니다.

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Cell-Free RNA as a Noninvasive Biomarker

이 연구는 바이오마커의 발견과 비침습적 의료 모니터링 분야에 대한 순환 세포유리 RNA(circulating cell-free RNA) 시퀀싱의 광범위한 활용 가능성을 보여 줍니다.

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