Illumina RNA Prep with Enrichment

광범위한 샘플 유형 및 RNA 입력량에서 강화되고 색인된 시퀀싱 라이브러리를 생산하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우입니다.

< 9시간

Assay 시간

< 2시간

수작업 시간

RNA 10 ng, FFPE RNA 20 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina RNA Prep with Enrichment는 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 간소화된 90분 단일 혼성화 단계를 사용하여 RNA 시퀀싱(RNA-Seq) 애플리케이션을 위한 매우 빠른 솔루션을 제공합니다. 

빠르고 간단하며 확장 가능한 워크플로우

2시간 미만의 실습 시간으로 총 9시간 이내에 시퀀스 준비 라이브러리를 준비하고 강화합니다. Illumina High-throughput 시퀀싱 기기와 함께 사용하면 실행당 훨씬 더 많은 샘플을 얻을 수 있습니다.

까다로운 샘플의 고품질 데이터

포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직과 같이 제한된 시재료 및 손상되거나 분해된 샘플에서 재현 가능한 결과를 전달할 수 있습니다.

저렴하고 철저한 RNA-Seq

시퀀싱 깊이의 일부만으로 검색 성능을 극대화합니다. Illumina RNA Prep with Enrichment는 탁월한 캡처 효율성과 적용 범위 균일성을 제공하여 바이어스 없이 정확하게 검출하기 위해 필요한 시퀀싱 깊이를 최소화하도록 설계되었습니다.

유연한 모듈형 패널 설계

최대 유연성을 위해 사전 구축되고 검증된 다양한 프로브 또는 맞춤형 프로브를 사용하여 대립유전자 특이적 발현, 융합 검출, 생체표지자 스크리닝 등을 검출하고 발견합니다.


사양


필수 제품

완전한 인리치먼트(enrichment)를 통한 RNA 준비 워크플로우에는 라이브러리 준비, 프로브 패널 및 인덱스 어댑터(모든 품목은 별도 판매)를 사용해야 합니다.

옵션 구성 요소는 다음과 같습니다.

  • Illumina RNA Fast Hyb Enrichment—권장되는 것과 다른 plexity로 처리하는 고객만을 위한 인리치먼트(enrichment) 시약 포함

  • Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation—권장되는 것과 다른 plexity로 처리하는 고객만을 위한 사전 인리치먼트(enrichment) 시약 포함

/ 결과

애플리케이션

Illumina RNA Prep with Enrichment는 대립유전자 특이적 발현, 유전자 융합(fusion) 검출, 생체표지자 스크리닝 등과 같은 검출 및 발견 연구를 지원하는 광범위한 RNA-Seq 애플리케이션을 위한 표적 시퀀싱 라이브러리의 준비에 있어 샘플 유형 및 RNA 투입량의 유연성을 가능하게 합니다.

예시 워크플로우


프로젝트 권장 사항

기기 Recommended number of samples Read length
NextSeq 550 System

Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel 

Mid output: 5 

High output: 16 

(based on 25M reads per sample) 

2 × 100 bp

NextSeq 1000 System, NextSeq 2000 System

Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel

P2: 16

P3: 48 

(based on 25M reads per sample) 

2 × 100 bp

NovaSeq 6000 System

Illumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel

SP: 32

S1: 64

S2: 164 

S4: 384

(based on 25M reads per sample)

2 × 100 bp

MiSeq System

Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance Panel or Pan-Coronavirus Panel

Up to 25 samples (based on 1M reads per sample)

2 × 150 bp

NextSeq 550 System

Illumina RNA Prep with Enrichment + Viral Surveillance Panel or Pan-Coronavirus Panel

Up to 384 samples (based on 1M reads per sample)

2 × 150 bp



관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료

비교하기

Illumina RNA Prep with Enrichment TruSeq RNA Exome Illumina Stranded mRNA Prep
Assay 시간 < 9시간 약 2일 6.5시간
자동화 기능 Liquid handling robots Liquid handling robots Liquid handling robots
콘텐츠 사양 Illumina Exome Panel과 함께 사용 시 코딩 전사물 캡처 코딩 전사체/RNA 엑솜 캡처 가닥 정보가 있는 코딩 전사체 캡처
설명 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직 및 기타 저품질 샘플 등 광범위한 샘플의 종류와 사용량으로부터 표적 전사물(transcript) 검출 및 발견 연구를 가능하게 하는 재현 가능하고 경제적인 솔루션입니다. 정밀한 가닥 정보와 샘플 사용량 요구 사항 감소로 연구자들에게 코딩 전사체에 대한 명확하고 종합적인 관점을 제공합니다. 정밀한 가닥 정보가 있는 코딩 전사체의 분석을 위한 단순하고 비용 효율적인 솔루션입니다.
수작업 시간 < 2시간 약 11시간 < 3시간
사용량 RNA 10 ng, FFPE RNA 20 ng 신선/냉동 샘플의 Total RNA 10 ng 또는 FFPE 샘플의 Total RNA 20 ng 표준 품질 Total RNA 25~1,000 ng
Instruments MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NovaSeq 6000 System NextSeq 550 System, HiSeq 3000 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System, HiSeq 4000 System NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System
작용 기전 Bead-linked transposome 코딩 RNA를 표적으로 하는 바이오틴화된 캡처 프로브. 폴리A 꼬리가 있는 RNA는 필요하지 않습니다. 폴리A 포획, 라이게이션 기반 어댑터 및 인덱스 추가
방법 mRNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment Exome sequencing, mRNA sequencing mRNA sequencing
멀티플렉싱 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI) 최대 24개 싱글, 96개 조합(CD) 듀얼 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI)
Nucleic acid type RNA RNA RNA
특수 샘플의 종류 Blood, Low-input samples, FFPE tissue Low-input samples, FFPE tissue Not FFPE-compatible, Low-input samples
Species category Human, Virus Human Mammalian, Bovine, Mouse, Human, Rat
Strand specificity Non-stranded Stranded Stranded
Technology Sequencing Sequencing Sequencing
변이 클래스 Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Novel transcripts, Transcript variants Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants

선택 도구:

그림 자료

Illumina RNA Prep with Enrichment는 빠른 워크플로우를 제공합니다.

온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation)과 90분 단일 혼성화 단계가 결합되어 TruSeq RNA Exome에 비해 더 적은 단계로 더 빠른 워크플로우를 제공합니다.

낮은 입력 샘플의 고품질 데이터

Illumina RNA Prep with Enrichment는 UHR(Universal Human Reference)에서 10 ng 및 100 ng Total RNA의 입력 양 간에 높은 데이터 일치를 달성합니다.

저입력 샘플에서 BCR -ABL1 유전자 융합 검출

Illumina RNA Prep with Enrichment 및 Illumina Exome Panel을 사용하여 K-562 세포주의 10 ng RNA로부터 준비된 라이브러리는 BCR -ABL1 유전자 융합을 성공적으로 검출하였습니다. 상단 정렬 트랙은 모든 리드를 나타내고, 하단 정렬 트랙은 BCR -ABL1 융합 유전자를 지원하는 리드만을 나타냅니다.

Illumina RNA Prep with Enrichment로 코딩 영역 커버리지

Illumina RNA Prep with Enrichment 및 Illumina Exome Panel을 사용하여 10 ng UHR RNA 및 20 ng FFPE RNA로부터 준비된 라이브러리는 코딩 전사물(transcript) 및 UTR에 정렬되어 생성된 데이터의 85% 이상을 보여줍니다. 비교를 위해 TruSeq RNA Exome 라이브러리의 데이터가 표시됩니다.

저입력 및 FFPE 샘플에서 유전자 융합 검출

K-562BCR-ABL1TPM3-NTRK1DV200% 검출률. DV200

융합(소스) RNA 입력 감지
BCR-ABL 1 (K-562) 7.4 10 ng 6/6회 반복(100%)
TPM3-NTRK1 (결장직장암) 2.5 20 ng 6/6회 반복(100%)

리소스

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라이브러리 프렙 (2)

Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (16 Samples)

20040536

16개의 라이브러리(16개의 1-플렉스 증균 반응)를 준비하고 증균하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널, 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Illumina® RNA Prep with Enrichment, (L) Tagmentation (96 Samples)

20040537

96개의 라이브러리(32, 3-플렉스 증균 반응)를 준비하고 증균하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널, 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (8)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스 포함. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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패널 (4)

Illumina Exome Panel – Enrichment Oligos Only

20020183

Illumina DNA Prep with Enrichment와 함께 사용할 경우 8개의 농축 반응에 충분하며, TruSeq RNA Exome과 함께 사용할 경우 12개의 반응, Illumina RNA prep with Enrichment와 함께 사용할 경우 32개의 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비 및 증균 시약과 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Respiratory Virus Oligos Panel V2

20044311

Illumina RNA Prep with Enrichment(96개 샘플) 키트와 함께 사용할 경우 32개의 3-플렉스 농축 반응에 충분합니다. 라이브러리 준비 및 강화 키트와 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Viral Surveillance Panel, RUO 96 Rxns

20088154

Illumina RNA Prep with Enrichment 키트와 함께 사용할 경우 32, 3-plex 농축 반응에 충분한 바이러스 감시 패널이 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 강화 키트와 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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Pan-Coronavirus Panel, RUO 96 Rxns

20088155

Illumina RNA Prep with Enrichment 키트와 함께 사용할 경우 32, 3-plex 농축 반응에 충분한 바이러스 감시 패널이 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 강화 키트와 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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서비스 (1)

Illumina RNA Library Prep with Enrichment Training

20044763

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액세서리 제품 (2)

Illumina RNA Fast Hyb Enrichment (16 Samples)

20040540

Illumina RNA Prep with Enrichment 키트의 빠른 혼성화 증균 시약이 포함되어 16개의 1-플렉스 증균 반응을 제공합니다. 권장 사항과 다른 플렉시티로 처리하는 고객을 지원합니다. 사전 농축 시약은 포함되지 않습니다. 증균을 통한 완전한 준비는 Illumina RNA Prep with Enrichment 키트를 주문하십시오.

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Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation (16 Samples)

20040542

16개의 라이브러리를 위한 Illumina RNA Prep with Enrichment 키트의 사전 농축 모듈을 포함합니다. 권장 사항과 다른 플렉시티로 처리하는 고객을 지원합니다. 증균 시약 및 정제 비드는 포함되지 않습니다. 증균을 통한 완전한 준비는 Illumina RNA Prep with Enrichment 키트를 주문하십시오.

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선택 품목 요약

제품

수량

Unit Price

FAQ

Illumina는 Agilent Technologies UHR(Universal Human Reference RNA)(카탈로그 번호 740000)을 양성 대조군 샘플로 사용할 것을 권장합니다.

Illumina Exome Panel, Respiratory Virus Oligos Panel V2, Viral Surveillance Panel 및 Pan-Coronavirus Panel은 Illumina RNA Prep and Enrichment 키트와 함께 사용할 수 있습니다.

 eBLTL은 신속 단일 반응 단계에서 어댑터 태그 서열을 단편화하고 추가함으로써 cDNA를 표지하는 증균 비드 결합 트랜스포솜이다.

16-반응 키트는 1-plex 워크플로우를 활성화하고 96-반응 키트는 3-plex 워크플로우를 활성화합니다. 권장되는 것과 다른 plexity로 처리하기 위해 두 워크플로우에 추가 액세서리 제품을 추가할 수 있습니다.
/ 결과

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.

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