NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
Illumina Stranded mRNA Prep은 새로운 아이소형, 유전자 융합 및 대립유전자 특이적 발현과 같은 특징의 발견을 위한 코딩 전사체 전반에 걸쳐 명확하고 포괄적인 분석을 위한 간소화된 RNA 시퀀싱(RNA-Seq) 솔루션을 제공합니다.
Illumina Stranded mRNA Prep
스트랜드 정보를 정밀하게 측정하여 단백질 코딩 전사체를 정확하고 공정하게 검출할 수 있는 빠르고 비용 효율적인 워크플로우입니다.
6.5시간
Assay 시간
< 3시간
수작업 시간
표준 품질 Total RNA 25~1,000 ng
사용량
개요
주요 기능
*FFPE 검체와 호환되지 않음
사양
| Assay 시간 | 6.5시간 |
|---|---|
| 자동화 기능 | Liquid handling robots |
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
| 콘텐츠 사양 | 가닥 정보가 있는 코딩 전사체 캡처 |
| 설명 | 정밀한 가닥 정보가 있는 코딩 전사체의 분석을 위한 단순하고 비용 효율적인 솔루션입니다. |
| 수작업 시간 | < 3시간 |
| 사용량 | 표준 품질 Total RNA 25~1,000 ng |
| Instruments | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 작용 기전 | 폴리A 포획, 라이게이션 기반 어댑터 및 인덱스 추가 |
| 방법 | mRNA sequencing |
| 멀티플렉싱 | 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI) |
| Nucleic acid type | RNA |
| 특수 샘플의 종류 | Not FFPE-compatible, Low-input samples |
| Species category | Mammalian, Bovine, Mouse, Human, Rat |
| 종 세부 사항 | 폴리A 꼬리가 있는 종의 고품질 RNA로 작업 |
| Strand specificity | Stranded |
| 시스템 호환성 세부 사항 | 라이브러리 준비는 모든 Illumina 시퀀싱 시스템과 호환되도록 설계되었으며 NextSeq 500/550 및 NovaSeq 6000 시스템에서 광범위한 검증 절차를 거쳤습니다. |
| Technology | Sequencing |
| 변이 클래스 | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
필수 제품
처리 요구에 맞는 라이브러리 준비 키트 크기(16개 샘플 또는 96개 샘플)를 선택합니다.
고유한 이중 인덱스는 별도로 판매되며 멀티플렉싱에 필요합니다. 표적 시퀀싱 처리량에 가장 적합한 인덱싱 옵션을 선택하십시오. 세트 A, B, C 및 D를 함께 추가하여 단일 실행에서 최대 384개의 샘플을 시퀀스할 수 있습니다. 시퀀싱 처리량 및 멀티플렉싱 기능은 시퀀서 및 플로우 셀 시약에 따라 다를 수 있습니다.
/
결과
애플리케이션
Illumina Stranded mRNA Prep을 사용하면 광범위한 샘플 유형에서 표준(비분해) RNA의 낮은 샘플 투입으로 하루에 시퀀싱 준비 전사체 라이브러리를 준비할 수 있습니다.
예시 워크플로우
준비
Illumina Stranded mRNA Prep
프로젝트 권장 사항
| 기기 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | Mid output: 5 |
2 × 75 bp |
| NextSeq 2000 System | P2: 16 |
2 × 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | SP: 32 |
2 × 75 bp |
관련 애플리케이션 및 방법
NGS를 사용한 mRNA 시퀀싱(mRNA-Seq)은 알려지거나 새로운 전사물을 모두 식별하고 전사물 풍부도를 측정할 수 있습니다.
차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 방법을 사용하여 단일 실험에서 전사체 변화를 분석하거나 유전체 차원의 유전자 발현 수준을 프로파일링하는 방법을 알아보세요.
약물 반응 RNA 생체표지자 분석에 대해 자세히 알아보세요.
치료 반응을 예측하는 RNA 기반 생체표지자의 평가는 점점 더 약물 개발 과정의 필수적인 부분이 되고 있습니다.
문서
제품 관련 자료
지원 문서
비교하기
| Illumina Stranded mRNA Prep | TruSeq Stranded mRNA | Illumina RNA Prep with Enrichment | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome | |
|---|---|---|---|---|
| Assay 시간 | 6.5시간 | ~10.5시간 | < 9시간 | 약 7시간 |
| 자동화 기능 | Liquid handling robots | Liquid handling robots | Liquid handling robots | Liquid handling robots |
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | ||
| 콘텐츠 사양 | 가닥 정보가 있는 코딩 전사체 캡처 | 가닥 정보가 있는 코딩 전사체 캡처 | Illumina Exome Panel과 함께 사용 시 코딩 전사물 캡처 | 코딩 RNA와 여러 형태의 비코딩 RNA 캡처 |
| 설명 | 정밀한 가닥 정보가 있는 코딩 전사체의 분석을 위한 단순하고 비용 효율적인 솔루션입니다. | 정밀한 가닥 정보로 연구자들에게 코딩 전사체에 대한 명확하고 종합적인 관점을 제공합니다. | 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직 및 기타 저품질 샘플 등 광범위한 샘플의 종류와 사용량으로부터 표적 전사물(transcript) 검출 및 발견 연구를 가능하게 하는 재현 가능하고 경제적인 솔루션입니다. | 다양한 RNA-Seq 애플리케이션을 지원하는 저 RNA 입력 및 저품질 샘플에서 전체 전사체 시퀀싱 준비 라이브러리를 준비하는 데 사용됩니다. 풍부한 전사체 분석을 용이하게 하기 위해 여러 종에서 rRNA 및 글로빈 RNA의 단일 튜브 고갈을 위한 Ribo-Zero Plus를 포함한다. |
| 수작업 시간 | < 3시간 | ~4.5시간 | < 2시간 | < 3시간 |
| 사용량 | 표준 품질 Total RNA 25~1,000 ng | Total RNA 0.1~1 ug 또는 이전에 분리한 mRNA 10~100 ng(폴리A 꼬리가 있는 종) | RNA 10 ng, FFPE RNA 20 ng | 표준 품질 RNA 검체에 대해 1–1000 ng 총 RNA. 최적의 성능 및 FFPE 검체에 대해 최소 10 ng 총 RNA 권장 |
| Instruments | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | MiSeq System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq X System, NextSeq 500 System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, MiniSeq System, NovaSeq 6000 System | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NovaSeq 6000 System |
| 작용 기전 | 폴리A 포획, 라이게이션 기반 어댑터 및 인덱스 추가 | Oligo-dT 비드가 폴리A 꼬리 포획 | Bead-linked transposome | 효소 rRNA 제거, 어댑터 및 인덱스의 라이게이션 기반 첨가 |
| 방법 | mRNA sequencing | mRNA sequencing | mRNA sequencing, Targeted RNA sequencing, Target enrichment | Whole-transcriptome sequencing, Metatranscriptome sequencing |
| 멀티플렉싱 | 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI) | 1~96 | 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI) | 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI) |
| Nucleic acid type | RNA | RNA | RNA | RNA |
| 특수 샘플의 종류 | Not FFPE-compatible, Low-input samples | Not FFPE-compatible | Blood, Low-input samples, FFPE tissue | Microbiome samples, Low-input samples, FFPE tissue |
| Species category | Mammalian, Bovine, Mouse, Human, Rat | Mammalian, Bovine, Mouse, Human, Rat | Human, Virus | Mouse, Human, Rat, Bacteria |
| 종 세부 사항 | 폴리A 꼬리가 있는 종의 고품질 RNA로 작업 | 폴리A 꼬리가 있는 종의 고품질 RNA로 작업 | Ribo-Zero Plus는 인간 세포질 및 미토콘드리아 rRNA, 마우스 rRNA, 랫트 rRNA, 박테리아(E. coli 및 B. 서브틸리스) rRNA, 및 인간 베타 글로빈 전사물을 포함하는 다수의 종으로부터 풍부한 전사물을 고갈시킨다. Ribo-Zero Plus 미생물군유전체는 Ribo-Zero Plus에서 고갈된 것들과 다양한 미생물종 및 ATCC MSA-2002, MSA-2005 및 MSA-2006 을 포함한 여러 종의 풍부한 전사물을 고갈시킨다. | |
| Strand specificity | Stranded | Stranded | Non-stranded | Stranded |
| 시스템 호환성 세부 사항 | 라이브러리 준비는 모든 Illumina 시퀀싱 시스템과 호환되도록 설계되었으며 NextSeq 500/550 및 NovaSeq 6000 시스템에서 광범위한 검증 절차를 거쳤습니다. | |||
| Technology | Sequencing | Sequencing | Sequencing | Sequencing |
| 변이 클래스 | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Gene fusions, Novel transcripts, Transcript variants |
선택 도구:
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그림 자료
성과 지표 비교
(왼쪽) Illumina 가닥 mRNA 제조(오른쪽) Illumina 가닥 mRNA 제조에 대한 성능 메트릭을 TruSeq 가닥 mRNA와 비교하였다. Illumina Stranded mRNA Prep은 특히 25 ng UHR RNA의 입력으로 우수한 성능을 보였다.
낮은 입력에서 더 큰 유전자 발견
Illumina Stranded mRNA Prep은 TruSeq Stranded mRNA에 비해 낮은 RNA 입력으로 더 큰 유전자 검출을 가능하게 합니다. 검출된 유전자의 수는 30M 서브샘플링된 쌍-말단 판독 PF에서 보고된다. 1배 범위로 검출되는 유전자가 많을수록 민감도가 높다는 지표입니다.
레거시 키트와의 높은 일치도
Illumina Stranded mRNA Prep은 (A) 100 ng UHR RNA의 등가 입력 및 (B) 25 ng 대 100 ng UHR RNA의 감소된 입력에서 TruSeq Stranded mRNA와 매우 일치하는 데이터를 생성합니다.
높은 데이터 일치성
Illumina Stranded mRNA Prep은 (A) 25 ng UHR RNA의 기술적 복제물과 (B) 25 ng 및 100 ng UHR RNA의 입력량 간에 높은 데이터 일치를 달성한다. 라이브러리를 2 × 74 bp에서 시퀀싱하고, 30M 판독으로 서브샘플링하였다. BaseSpace RNA-Seq 정렬 앱을 사용하여 데이터 분석을 수행하였다.
Illumina Stranded mRNA Prep 워크플로우
Illumina Stranded mRNA Prep은 작업 시간을 단축하면서 빠른 워크플로를 제공합니다. 시간은 사용된 장비, 처리된 샘플 수, 자동화 절차 또는 사용자 경험에 따라 달라질 수 있습니다.
FAQ
중복 유전자로부터 유전자 발현을 정확하게 확인하기 위해, 기원 가닥에서 발견되는 정보를 보관하는 것이 중요하다. 가닥화된 RNA-Seq는 제1 및 제2 cDNA 가닥이 구별될 수 있게 하여, 제1 cDNA 가닥(원산지 가닥)이 추가 PCR 증폭을 거치는 동안 제2 가닥이 분해될 수 있게 한다.
라이브러리 준비에는 6.5시간이 소요되며 실제 작업 시간은 3시간 미만입니다.
올리고(dT) 자성 비드는 폴리A 꼬리를 함유하는 mRNA를 포획하고 정제한다. 정제된 mRNA를 단편화하고 역전사효소 및 무작위 프라이머를 사용하여 1가 cDNA로 복사한다. 두 번째 가닥 cDNA 합성 단계에서, dUTP는 가닥 특이성을 달성하기 위해 dTTP를 대체한다. 최종 단계는 아데닌 및 티민 염기를 단편 말단 및 결찰 어댑터에 첨가한다. 생성된 생성물을 정제하고 시퀀싱을 위해 선택적으로 증폭시킨다.
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결과
라이브러리 프렙 (2)
Illumina® Stranded mRNA Prep, Ligation (16 Samples)
20040532
16개의 라이브러리(16개의 1-플렉스 증균 반응)를 준비하고 증균하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널, 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.
List Price:
Discounts:
Illumina® Stranded mRNA Prep, Ligation (96 Samples)
20040534
96개 라이브러리(32, 3-플렉스 농축 반응)를 준비하고 농축하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 증균 프로브 패널, 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.
List Price:
Discounts:
인덱스 어댑터 (8)
Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091655
Illumina® RNA UD 인덱스 세트 A, 결찰(96 인덱스, 96 샘플) 96개의 샘플 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 시약을 별도로 구입합니다.
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091657
Illumina® RNA UD 인덱스 세트 B, 결찰(96 인덱스, 96 샘플) 96개의 샘플 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 시약을 별도로 구입합니다.
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091659
Illumina® RNA UD 인덱스 세트 C, 결찰(96 인덱스, 96 샘플) 96개의 샘플 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 시약을 별도로 구입합니다.
List Price:
Discounts:
Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20091661
Illumina® RNA UD 인덱스 세트 D, 결찰(96 인덱스, 96 샘플) 96개의 샘플 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 시약을 별도로 구입합니다.
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040553
96개의 검체 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040554
96개의 검체 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스 포함. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set C, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040555
96개의 검체 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스를 포함합니다. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.
List Price:
Discounts:
IDT® for Illumina® RNA UD Indexes Set D, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)
20040556
96개의 검체 및 RNA 인덱스 앵커 플레이트에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스 포함. Illumina Stranded Total RNA Prep 및 Illumina Stranded mRNA Prep 키트와 함께 사용됩니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.
List Price:
Discounts:
서비스 (1)
Illumina Stranded mRNA Library Prep Training
20044765
표시 /
선택 품목 요약
제품
수량
Unit Price
품목이 장바구니에 담겼습니다
요약
제품
카탈로그 ID
수량
단가
-
카탈로그 ID:수량:
/
결과
MiSeq Reagent Kit v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트입니다.
TruSight Oncology 500
FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.
Illumina DNA Prep
광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용하기 위한 매우 정확한 데이터를 생성하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 프렙 워크플로우입니다.
NextSeq 1000/2000 Reagents
NextSeq 1000/2000 시스템용 시약은 사용하기 쉬운 카트리지와 유연한 시퀀싱 옵션을 위한 다중 플로우 셀 구성이 특징입니다.
Illumina UD Indexes
고유한 듀얼(UD) 인덱스를 사용하면 처리량을 늘리고 비용 절감의 이점을 위해 다중화할 수 있는 고품질 라이브러리를 준비할 수 있습니다.
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus or Ribo-Zero Plus Microbiome
코딩 및 비코딩 전사체 전반에 걸쳐 명확하고 포괄적인 분석을 위한 간소화된 RNA-Seq 솔루션으로 탁월한 연구 유연성을 제공합니다.
Illumina RNA Prep with Enrichment
광범위한 샘플 유형 및 RNA 입력량에서 강화되고 색인된 시퀀싱 라이브러리를 생산하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우입니다.
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